Kantor Kementerian Agama Kabupaten Purbalingga membawahi 18 Kantor Urusan Agama (KUA) yang berada di kecamatan dilingkungan Kabupaten Purbalingga adapun daftar KUA sebagai berikut:

1. KUA Bobotsari
2. KUA Bojongsari
3. KUA Bukateja
4. KUA Kaligondang
5. KUA Kalimanah
6. KUA Karanganyar
7. KUA Karangjambu
8. KUA Karangmoncol
9. KUA Karangreja
10. KUA Kejobong
11. KUA Kemangkon
12. KUA Kertanegara
13. KUA Kutasari
14. KUA Mrebet
15. KUA Padamara
16. KUA Pengadegan
17. KUA Purbalingga
18. KUA Rembang